H05基因體與生物資訊研究平台服務

壹、儀器設備說明 (規格)：

本平台係基於叢集架構，並搭配圖形處理器(GPU)與大量儲存設備建構之運算主機，利用其適合單一且大量重複計算的特性，提供一個具高速運算效能的基因體資訊演算環境，加速相關研究之進行。本平台包含：

• 高效能運算叢集系統：基因體資訊演算法研發、非模式物種基因體解析系統
• NGS商用分析軟體

一、硬體規格

• 控制節點*2

1. Fujitsu PRIMERGY RX300 S7

2. Intel Xeon E5-2630 8C/16T 2.00GHz 20 MB x2

3. 72GB DDR3-1333 ECC

• 控制節點*8

1. Fujitsu PRIMERGY RX350 S7

2. Intel Xeon E5-2650 8C/16T 2.00GHz 20 MB x2

3. Coprocessor - 1-2 NVIDIA® Tesla™ K20C GPGPU

4. 512GB DDR3-1333 ECC

二、軟體規格

• 作業系統

Red Hat Enterprise Linux Server release 6.4 (Santiago)

• 應用套件

貳、服務項目：

1. 提供商用軟體MetaCore，採付費預約使用。
2. 提供多種應用套件與其高速運算效能，滿足研究需求之執行，如: 次世代定序(NGS)分析、非模式物種基因體分析、基因體註解、蛋白質結構、組裝，提供Assembly/Mapping/Annotation軟體與相關Pipeline皆提供服務。

參、取樣、使用應注意事項：

• 申請時需說明使用目的、來源IP，經核准後方能開放使用。
• 設備使用方式：由使用者在自備電腦或終端機，以SSH登入/操作機器
• 每帳號空間最多為1.5TB(包含使用者上傳與產生的檔案)，每季統計該帳號空間使用情況，並通知清理空間。
• 使用本系統所產生的資料，於成果發表時，並不要需要將服務提供者列為共同作者，但須於文章之致謝欄中載明。

肆、使用時段與預約：

1.  商用軟體：開放24小時線上預約系統，自己掌握可用時段。

2.  高效能運算叢集系統：開放24小時以Queue排程指令執行。

※上述服務如遇設備或網路維護將公告並暫停使用。

伍、訓練課程規定辦法

陸、收費辦法及標準(含訓練課程)：

校內學術:

無單位配合款

有單位配合款

• Metacore:每時段400元(採預付制)
• 高效能運算叢集系統: 需填寫申請單，經核准後方能開放使用。

管理單位

其他

同左
 

同左

校外學術：

• Metacore:每時段600元(採預付制)

業界：

• Metacore:每時段800元(採預付制)

柒、儀器聯絡與管理人：  

第一管理者：陳立臻 em61330@email.ncku.edu.tw

第二管理者：陳佳音

諮詢教授：孫孝芳，分機：3648

儀器放置地點：成功校區資訊大樓5樓

捌、其他注意事項：

本平台僅提供高速計算服務，無備份責任，並保留更改/重設/刪除工作資料夾之權利。